沙眼病原微生物易于通过多种不同途径进行传播。患沙眼者常有眼红和黏性分泌物，并且有时流鼻涕，分泌物中含有的沙眼病原微生物很容易传播。当人们紧密接触时，沙眼病原微生物通过手指、衣物、毛巾、洗脸用具和其他所接触物品的交互接触而传播；当苍蝇飞到眼部时则将眼分泌物（含有沙眼病原微生物）从一个人传递至其他人。以上情况均可造成患者重复感染，从而增加沙眼炎症的严重程度。可见沙眼的传播与患者的卫生习惯、生活条件、居住环境、营养状况、医疗条件等因素密切相关。因此沙眼主要发生在卫生条件差和缺乏水源的地区，具有明显的地域性。
预防沙眼是一个重要的公共卫生问题。由于沙眼衣原体常附着在患眼的分泌物中，任何与分泌物的接触均可造成沙眼传播感染，因此加强卫生宣传教育，普及卫生知识，培养良好卫生习惯，保持面部清洁，不用手揉眼，手巾、手帕要勤洗、晒干；托儿所、学校、工厂等集体单位的睡眠区进行分隔和通风；分盆分毛巾或用流水洗脸，加强理发室、浴室、旅馆等服务行业的卫生管理，严格毛巾、脸盆等消毒制度；合理处理垃圾，改善厕所环境，减少或消灭苍蝇，并注意水源清洁，可以阻断沙眼传播的途径，减少和防止沙眼的感染流行。